菊分支NCED酶分子特征及进化分析

摘要：

为探究9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)基因家族进化特性,本文利用生物信息学方法,对菊分支类群已完成测序的植物(包括番茄、马铃薯、烟草、甜菜、猴面花)基于全基因组进行NCED基因家族鉴定,并对其蛋白序列特征,保守基序,次级结构以及系统发育关系进行分析.结果表明,NCED酶是由小基因家族编码的酶,其成员为2～4个.蛋白质氨基酸大小在505 ～ 652aa之间,分子质量为56.23 ～71.42 kDa,除SlNCED6外,其余各蛋白的等电点均表现为酸性,保守基序分析发现各成员均包含10个保守基序,其长度在29～ 50之间.此外,NCEDs蛋白结构分析显示,一级结构氨基酸序列N端保守性较低,而次级结构均表现为高度保守.系统发育关系发现,来自番茄的SlNCED5、SlNCED6与来自马铃薯的StNCED5、StNCED6分别为直系同源蛋白,这与生物学上的亲缘关系一致.

关键词：9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶、菊分支、生物信息学、进化

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资助基金：浙江省自然科学基金LQ12C15004,国家自然科学基金资助项目31071800,浙江省农业新品种选育重大科技专项2012C12903,农业部公益性行业农业科研专项经费201403032,201003065,国家科技支撑计划2012BAD02B02,农业部产业化项目CARS-25-G-16

在线出版日期：2015-04-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：278-289