番茄NBS-LRR抗病基因家族全基因组分析

摘要：

NBS-LRR(nucleotide-binding site and leucine-rich-repeat)是植物中最大类抗病基因家族之一.番茄基因组测序完成为全基因组水平上分析NBS-LRR抗病基因家族提供了机遇.利用生物信息学方法对番茄NBS-LRR抗病基因家族成员数目进行鉴定,并对其染色体定位和系统发育关系进行了分析.随后,将番茄和马铃薯NBS-LRR抗病基因进行了比较基因组学分析.结果表明:番茄基因组共包括252个NBS-LRR抗病基因,分布于番茄12条染色体上;63.5％的基因成簇存在,大部分为串联重复;系统发育关系分析表明番茄CC-NBS-LRR(CNL)亚家族较其他亚家族扩展程度大;同线性分析发现番茄中共79个NBS-LRR抗病基因与马铃薯基因具有同源关系.结果将为番茄NBS-LRR抗病基因家族的深入研究提供依据,同时也为利用番茄NBS-LRR基因进行基因定位以及相关抗病基因克隆等奠定基础.

关键词：番茄、NBS-LRR、CNL、TNL、抗病基因

所属期刊栏目：28

在线出版日期：2014-06-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：790-799