番茄Hsp70基因鉴定及系统发育关系分析

摘要：

热激蛋白70(heat shock protein 70,Hsp70)是植物应对高温和其他胁迫环境时所产生的一类特定的应激蛋白.本文以番茄基因组数据为基础,利用生物信息学方法对Hsp70基因家族进行鉴定与分析.结果表明,番茄至少含有22个Hsp70基因成员,蛋白质序列长度为210-890个氨基酸之间,具有0～12个内含子;具有4对重复基因;滑动窗口分析结果表明,这些基因中的一些区段(或者位点)可能受到正选择的压力.此外,序列比对发现这些Hsp70基因家族成员具有多个保守基序;染色体定位发现他们不均匀分布在番茄的11条染色体上;系统发育关系揭示番茄和拟南芥Hsp70基因家族成员可以分为4组,每组成员数目是变异的,并且存在3对旁系同源基因和7对直系同源基因,表明Hsp70基因家族在番茄和拟南芥分化之前就已经存在.

关键词：番茄、Hsp70、生物信息学、系统发育关系

所属期刊栏目：28

资助基金：国家自然科学基金31301774、31272156;浙江省自然科学基金LQ12C15004;浙江省农业新品种选育重大科技专项2012C12903;浙江省优先主题项目2011C12004;国家“863”计划2012AA100100

在线出版日期：2014-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：378-385