不同单株叶籽银杏DNA甲基化水平与模式的MSAP分析

摘要：

以叶籽银杏和普通银杏叶片为试材,利用EcoR Ⅰ和HpaⅡ/MspⅠ双酶切建立适合于叶籽银杏全基因组的甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析体系,在全基因组水平对11株叶籽银杏和1株正常银杏的胞嘧啶甲基化水平和模式进行评估.结果表明,从36对MSAP选扩引物中,选出14对MSAP引物组合,共扩增产生2766条清晰可辨且可重复的DNA条带,产生3种类型的甲基化条带.在全部扩增位点中,检测到叶籽银杏基因组CCGG序列的甲基化比率为26.42％ ～ 65.79％,正常银杏总甲基化率达30.79％,不同单株的叶籽银杏平均总甲基化率达38.61％,叶籽银杏甲基化事件的发生频率为11.27％～27.34％.方差分析显示不同单株间DNA甲基化水平差异极显著.主成分分析绘制的主分量散点图与聚类分析结果一致,不同单株的叶籽银杏可分为3大类.

关键词：叶籽银杏、DNA甲基化、MSAP分析、表观遗传学

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资助基金：国家自然科学基金31070589;高等学校博士学科点专项科研基金20093702110009

在线出版日期：2013-06-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：399-407