沪油15中两个AP2/ERF-B1亚族转录因子的克隆与分析

摘要：

利用油菜EST数据库,以拟南芥ERF-B1亚族转录因子序列为探针,电子克隆拼接得到2个cDNA序列(BnaERFB1-1和BnaERFB1-2),通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型油菜沪油15的DNA和cDNA中克隆了上述基因.克隆转录因子BnaERFB1-1Hy15和BnaERFB1-2-Hy15与电子克隆的序列差异很小,分别只有2个和6个氨基酸位点不同,且都没有内含子.从cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、进化树、序列比对、功能域、二级和三级结构等方面进行了分析,结果显示,BnaERFB1-1-Hy15和BnaERFB1-2-Hy15转录因子属于AP2/ERF家族中的ERF-B1亚族,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与拟南芥atERF7相似.EST丰度分析显示,BnaERFB1-1的表达主要集中在种子中,而BnaERFB1-2的表达则主要集中在分生组织中.

关键词：AP2/ERF、B1亚族、转录因子、克隆、沪油15

所属期刊栏目：23

分类号：S6(园艺)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2006AA10Z117;2008AA10Z401;上海市青年科技启明星跟踪计划08QH14021;上海市自然科学基金08ZR1417200;上海市国际合作项目08540706500

在线出版日期：2009-07-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：435-441,453