一种预测三阴性乳腺癌生存以及药物敏感性的新型失巢凋亡相关基因模型

摘要：

目的:失巢凋亡(anoikis)是一种特殊类型的细胞凋亡,主要发生在细胞与基质联系丧失(失去锚定)时,对维护体内环境稳定起着重要的作用.本研究旨在构建一个在三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)中与失巢凋亡相关的基因集以及预后模型,同时可以用于预测患者有效治疗药物.方法:对TCGA-BRCA数据集中的TNBC患者进行单因素和多因素Cox分析,以得出失巢凋亡相关基因集(anoikis-related gene signature,ARGS).采用Gene Expression Omnibus(GEO)数据集进行独立验证.将ARGS与临床病理参数结合生成一个诺莫图模型(Nomogram Model).采用各类统计学方法进行预测能力评价.根据ARGS所计算的中位数进行分层的高低风险TNBC患者组中进行治疗药物敏感性的分析.CCK-8细胞活力实验与流式细胞术将用来分析TNBC细胞对治疗药物的敏感性.结果:我们构建了一个由7个基因组成的ARGS,并用于计算风险分数,将TNBC患者分为高风险和低风险组,高风险组患者比低风险组患者的总生存期(overall survival,OS)明显更差.随后生成一个具有优异性能的能对患者生存情况分层的诺莫图模型,预测出了高风险的TNBC患者对替尼类药物(酪氨酸激酶抑制剂)的敏感性更强.在体外实验中,我们发现细胞系风险分数越高,则其对替尼类药物的敏感性更强.结论:在TNBC中构建了可以预测患者生存以及药物敏感性的失巢凋亡相关基因集,同时构建了结合患者临床病理信息可以预测患者生存情况的诺莫图模型.

关键词：三阴性乳腺癌、失巢凋亡、基因集、药物敏感性

所属期刊栏目：20

分类号：R737.9(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金

在线出版日期：2023-08-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：16-23,53