SARS-CoV-2刺突糖蛋白结构特征和抗原表位分析

摘要：

目的:为深入了解新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)的刺突糖蛋白(spike glycoprotein)的结构特征和抗原表位.方法:以SARS-CoV-2的刺突糖蛋白的氨基酸序列为对象,通过Clustalw2.1比对分析与SARS-CoV的相似性;并且利用ProtParam分析刺突糖蛋白的理化性质;ProtScale分析亲/疏水性;TMHMM 2.0、SignalP 4.0、Netphos 3.1、NetGlyc 1.0对刺突糖蛋白的跨膜区域、信号肽、磷酸化和糖基化位点进行预测和分析;SOMPA和SWISS-MODEL服务器预测刺突糖蛋白的二级结构、三级结构模型;Prankweb平台分析可能的配体结合区域位点;ABCpred和SYFPEITHI对刺突糖蛋白进行B/T细胞表位的预测分析.结果:SARS-CoV-2刺突糖蛋白由1273个氨基酸构成,其中亮氨基酸含量最高;分子量为141178.47 kDa,等电点为6.24,半衰期为30 h,稳定系数为33.01;含有一个跨膜结构域和信号肽;存在136个磷酸化与17个N-糖基化修饰位点;二级结构主要以不规则卷曲结构构成,三级结构能与已知的7cn8.1.A(SMTL ID)模型同源建模;具有多个配体结合位点区域以及24个B细胞表位和12个T细胞表位.结论:通过生物信息学方法分析SARS-CoV-2刺突糖蛋白性质和表位,为促进新冠病毒肺炎疫苗和药物的研发提供参考.

关键词：新型冠状病毒(SARS-CoV-2)、刺突糖蛋白、抗原表位、生物信息学

所属期刊栏目：19

分类号：R373.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：湖南省自然科学基金科教联合项目;湖南省财政厅卫生科技计划项目

在线出版日期：2023-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：29-37