基于TRPC相关基因构建膀胱癌预测模型

摘要：

目的:通过分析经典瞬时受体电位通道(TRPC)相关基因,构建膀胱癌亚型及相关预后模型,旨在为膀胱癌患者提供较准确的预后判断.方法:从GENECARD获取TRPC相关基因,并从TCGA数据库下载膀胱癌患者的RNAseq数据、临床数据.对TRPC相关基因进行富集分析,运用NMF算法将膀胱癌样本进行肿瘤亚型分组并进行临床信息统计及生存分析.运用LASSO回归筛选构建预后模型,并绘制列线图和进行验证.结果:从GENECARD获取了364个TRPC相关基因,运用NMF算法将BLCA患者分为三组,结果显示,C3患者的预后最差,C2患者的预后最好,且不同分组之间有统计学差异.发现在不同分组中年龄、性别、AJCC分期、分级、T分期、N分期均有统计学差异.通过LASSO回归及交叉验证,最终筛选出6个基因构建相关预后模型,依据计算出的风险值将患者分为高危、低危两组,经统计两组生存有明显差异,且风险值为膀胱癌独立预后因素,最后绘制了列线图及校正曲线.结论:本研究基于TRPC相关基因构建了膀胱癌预测模型,经验证该模型较传统病理及TNM分期有较高准确性,并筛选出影响膀胱癌患者预后的关键基因,可为后续机制研究提供理论基础.

关键词：膀胱癌、肿瘤亚型、预测模型、生物信息学

所属期刊栏目：19

分类号：R737.14(肿瘤学)

资助基金：湖南省卫生健康委课题202204053210

在线出版日期：2022-07-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：201-206