痰中结核分枝杆菌DNA提取方法的比较及在LAMP检测中的应用

摘要：

目的：对5种DNA提取方法进行比对，为选择适用于痰中结核分枝杆菌DNA的提取方法提供依据。方法：采用PureLink genomic DNA kits (PLKm)、苯酚与氯仿法(PCm)、Chelex-100法(Cm)、磷酸盐缓冲液法(PBm)及硅珠法(SBm)5种方法提取痰标本中的DNA，对提取产物的浓度、纯度等技术指标进行分析，并对核酸扩增结果进行统计。结果：DNA浓度均值由高到低依次是PBm、Cm、PCm、SBm、PLKm，组间比较差异有统计学意义，两两比较发现PLKm与PCm、Cm、PBm之间差异有统计学意义，但Cm与SBm间的比较有统计学意义；5种提取方法的OD260：OD280比值均值与1.8的接近程度依次是PLKm、PCm、Cm、PBm、SBm，组间比较差异有统计学意义，两两比较发现除SBm与另外4种方法间存的差异具有统计学意义外，其余各组间的比较均无统计学意义；采用PLKm、PCm及Cm提取的产物均扩增出阳性结果，而PBm、SBm提取产物分别有18例和11例未获得阳性结果，经Mc-Nemar x2检验方法间的差异有统计学意义。结论：Chelex-100提取痰标本中结核分枝杆菌DNA是一种简便、省时、廉价适用于基层结核病实验室进行核酸检测的方法。

关键词：结核分支杆菌、DNA提取、痰

分类号：R183.3(流行病学与防疫)

资助基金：长沙市科技计划项目K1104052-21

在线出版日期：2014-03-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：61-65