青花菜花蕾发育LncRNAs内参基因筛选

摘要：

在分析青花菜花蕾发育过程长链非编码RNA(LncRNAs)的表达中,筛选稳定表达的内参基因至关重要.通过前期高通量测序筛选出16个候选内参基因,利用qRT-PCR技术检测其表达水平,并结合geNorm、NormFinder和BestKeeper 3个软件对16个LncRNAs在青花菜花蕾不同部位和不同发育时期的表达稳定性进行分析.结果表明,在花蕾不同部位中,geNorm算法认为XLOC_000400、XLOC_008536、XLOC_034059 为最适内参基因;NormFinder 计算 XLOC_021473、XLOC_000400、XLOC_034059 为最佳内参基因;BestKeeper显示XLOC_025578表达最稳定.在花蕾不同发育时期中,geNorm算法认为XLOC_000108、XLOC_039609、XLOC_021473 为最适内参基因;NormFinder 计算 XLOC_021473、XLOC_039609、XLOC_000108为最佳内参基因;BestKeeper显示XLOC_034059表达最稳定.综合评估后,在花蕾不同部位和不同发育时期中适宜的内参基因对分别为XLOC_000400/XLOC_008536和XLOC_039609/XLOC_021473.

关键词：青花菜、内参基因、长链非编码RNA、花蕾

所属期刊栏目：52

分类号：S635.9(蔬菜园艺)

资助基金：云南省地方本科高校部分基础研究联合专项;浙江省自然科学基金项目;浙江省农业蔬菜新品种选育新品种选育重大科技专项子项目;温州市科技项目;浙江省教育厅一般项目

在线出版日期：2023-03-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：125-133