白菜NPF基因家族成员的鉴定及其生物信息学分析

摘要：

NPF基因家族是植物体内普遍存在的硝酸盐转运蛋白,同时负责硫苷、多肽、钾盐、植物激素等物质的运输.为了明确白菜NPF基因家族的功能和进化关系,利用生物信息学方法鉴定了白菜的NPF基因家族成员,并对NPF基因家族蛋白进行了理化性质、二级结构、亚细胞定位、保守基序分布以及与拟南芥的进化关系分析,对白菜NPF基因家族成员进行了基因结构以及染色体定位分析.结果表明,白菜NPF基因家族共有72个成员,编码蛋白质的氨基酸数量在497～1117个,分子质量在54.49～123.21 ku,等电点在5.72～9.47,大部分为稳定的碱性蛋白.二级结构以α-螺旋为主,其次是无规则卷曲,亚细胞定位预测均在质膜上.系统进化树将白菜NPF基因家族蛋白分为8个亚族,其保守性较高.白菜NPF基因家族成员大部分含有4个CDS序列.72个NPF基因家族成员不均匀地分布在白菜10条染色体上.

关键词：白菜;NPF基因家族;生物信息学;理化性质;保守基序

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分类号：S634.1(蔬菜园艺)

资助基金：山西省重点研发计划项目201703D211001-04-01,201803D221005-8

在线出版日期：2021-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：117-127