基于SSR标记的朝天椒种质遗传多样性分析

摘要：

探究以贵州为主的西南地区朝天椒种质遗传多样性,为朝天椒种质的保续、利用与分子标记辅助选择提供准确参考依据.利用20个SSR(简单串联重复序列)分子标记,对112份西南地区朝天椒种质资源进行遗传多样性分析.结果表明,20对SSR引物共检测出65个等位变异,每对引物的等位变异为2～4个,平均每对引物3.25个等位变异,平均有效等位基因数为1.8294,平均多态性信息量(PIC)为0.5440,平均Shannon's信息指数(I)为0.7234,观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Nei's期望杂合度的平均值分别为0.4920、0.4337、0.4318,所筛选出的20对SSR引物多态性较高,能较好地反映朝天椒不同地方种间的遗传多样性信息.聚类结果表明,供试材料居群间遗传相似系数(GS)值为0.5692～0.9538,平均值为0.7733,朝天椒种质间的遗传相似性相对较高,材料间的亲缘关系比较接近.在GS值0.7670处将供试材料分为4类,显示出112份朝天椒材料总体情况与地理分布有一定关联,但也存在区域间和省内外间的互相渗透,每个类别均聚集了不同地理来源的种质.

关键词：朝天椒、种质资源、SSR标记、遗传多样性、亲缘关系

所属期刊栏目：49

分类号：S641.3

资助基金：国家自然科学基金项目;贵州省科技厅农业攻关项目;贵州大学博士基金项目;贵州省科技厅科技支撑项目;贵州省生物学一流学科建设项目

在线出版日期：2020-07-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：101-109