高粱TCP基因家族全基因组鉴定及表达分析

摘要：

为了研究高粱TCP( Teosinte branched 1/cycloidea/proliferating cell factors)基因家族在生长发育和逆境胁迫中的作用,利用生物信息学方法对高粱TCP基因家族成员进行鉴定,并对其进行染色体定位、保守结构域、进化树和表达模式分析.结果表明,共鉴定出27个高粱TCP基因,其在9条染色体上呈不均匀分布,并在3、6、9 号等染色体上存在明显的基因簇.进化树分析显示,高粱TCP蛋白可被分为ClassⅠ和ClassⅡ 2 大类,而ClassⅡ类又可分为CYC/TB1 和CIN 2 个亚类, ClassⅠ包含10个TCP蛋白, CYC/TB1包含3个TCP蛋白,CIN包含14个TCP蛋白. 27个高粱TCP蛋白均有非典型的bHLH( Basic-helix-loop-helix)保守区,其中2个有R结构域.表达模式分析表明,大部分高粱TCP基因在种子、胚、雌蕊、早期花序中表达;PEG处理下,高粱根中大部分TCP基因表达量升高,ABA处理嫩枝中个别基因表达量升高,推测上调表达的高粱TCP基因可能在干旱胁迫响应过程中起重要作用.

关键词：高粱、TCP基因、全基因组鉴定、表达分析、ABA处理、PEG处理

所属期刊栏目：48

分类号：S514(禾谷类作物)

资助基金：河南省科技攻关计划项目192102110035

在线出版日期：2019-11-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：30-36