小粒黑豆GmRHF1基因生物信息学及线虫诱导表达分析

摘要：

为研究E3泛素连接酶基因在大豆抗线虫病害中的功能,利用RT-PCR方法从大豆胞囊线虫(Heterodera glycines)侵染的小粒黑豆(Glycine max)根部组织中克隆到1个E3泛素连接酶RING家族基因GmRHF1.序列分析结果显示,该基因位于大豆基因组3号染色体上,具有一个完整的外显子,编码区长度783 bp,编码260个氨基酸,含有1个RING-H2模体和1个跨膜结构域.蛋白质分子质量为27880.43 u,理论等电点为5.59.同源性比对及系统进化分析表明,该蛋白质与ATL3蛋白亲缘关系最近,属于RING-H2 zinc finger ATL3类.实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析GmRHF1受大豆胞囊线虫侵染的诱导表达情况,结果表明,接种后48 h内该基因的表达量较未接种的样品显著增加,推测该基因介导小粒黑豆抗大豆胞囊线虫的防御反应.

关键词：大豆、RING-H2 zinc finger蛋白、生物信息学、表达模式、大豆胞囊线虫

所属期刊栏目：48

分类号：S435.651(病虫害及其防治)

资助基金：黑龙江省教育厅基本科研业务费科研项目135309361;国家自然科学基金项目31801725

在线出版日期：2019-08-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：74-80