大豆FLAs蛋白理化性质和结构特征的生物信息学分析

摘要：

基于已公布的大豆基因组数据库,鉴定大豆类成束阿拉伯半乳糖蛋白(fasciclin-like arabinogalactan proteins,FLAs)基因,并对其基本理化性质、保守基序、功能域、系统发生树、蛋白质二级结构等进行综合分析.结果显示,从大豆基因组中共鉴定出33个FLAs,其编码的蛋白质氨基酸长度在237~455 aa,分子质量在25.483 0~50.578 5 ku,理论等电点在4.33~9.56.亚细胞定位分析显示,GmFLAs均定位在质膜上(其中GmFLA4/25也可定位在叶绿体中).GmFLAs含有1~2个该家族的保守成束蛋白质结构域(fasciclin domains,FAS).系统进化分析显示,大豆和拟南芥FLAs的同源性不高.GmFLAs二级结构均由α螺旋、无规则卷曲和延伸链等元件组成,其中,延伸链的比例最低,无规则卷曲比例最高.

关键词：大豆、类成束阿拉伯半乳糖蛋白、理化性质、结构特征、生物信息学分析

所属期刊栏目：46

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：Trans助研梦想基金项目Trans-RasDF-019

在线出版日期：2017-05-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：34-40