绵羊 IGFBP -6基因的克隆及序列分析

摘要：

以凉山半细毛羊为研究对象,克隆了其胰岛素样生长因子结合蛋白6基因(IGFBP -6),采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对 IGFBP -6蛋白的理化性质进行分析,并对其二级和三级结构进行预测。结果表明,绵羊 IGFBP -6基因的 CDS 全长序列为711 bp,编码236个氨基酸,与牛、人、鼠的 CDS 同源性分别为96%、84%、74%,氨基酸序列同源性分别为95%、80%、69%；IGFBP -6蛋白大小为24.9 ku,理论等电点(pI)为8.83。遗传进化分析结果显示,绵羊 IGFBP -6基因与山羊、牛等哺乳动物关系较近,与鱼类的亲缘关系较远。 IGFBP -6蛋白存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有1个信号肽、14个磷酸化位点、3个 N -糖基化位点和7个 O -糖基化位点；二级结构分析结果显示,IGFBP -6蛋白无规则卷曲、α-螺旋和β-折叠区域比例分别为77.54%、19.92%、2.54%；三级结构分析结果显示,IGFBP -6蛋白存在 IGFBP_N 和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域。

关键词：绵羊、IGFBP-6 基因、克隆、生物信息学

分类号：S813.3(普通畜牧学)

资助基金：农业部公益性行业科研专项201003061;四川省畜禽育种攻关项目01NG029-18

在线出版日期：2015-06-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：144-148