希金斯炭疽菌中5个典型Septin的生物信息学分析

摘要：

希金斯炭疽菌可以侵染菜心、萝卜等众多十字花科蔬菜引起炭疽病,给农业生产造成巨大的经济损失.septin是一个广泛存在于除植物以外其他生物的基因家族,其功能与细胞分裂、细胞内物质运输以及细胞周期的调控与细胞凋亡等关系密切,将成为新开发药物的潜在靶标.基于酿酒酵母中7个典型Septin蛋白的氨基酸序列,对炭疽菌属蛋白质数据库进行Blastp比对和关键词搜索,并通过SMART在线分析最终明确希金斯炭疽菌中含有5个典型的Septin.同时,从理化性质、跨膜区结构、二级结构以及亚细胞定位等方面对Septin进行生物信息学分析,结果显示,上述Septin均为亲水性蛋白,且不具有跨膜结构,其二级结构及亚细胞定位情况不同.

关键词：希金斯炭疽菌、Septin蛋白、生物信息学分析、理化性质、亚细胞定位、二级结构

所属期刊栏目：43

分类号：S436.3(病虫害及其防治)

资助基金：云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目ZK11A101,ZK11SB01;云南省重点学科森林保护学科研项目XKZ200905

在线出版日期：2014-10-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：91-96