拟南芥和水稻UXS基因家族生物信息学分析

摘要：

以6个拟南芥和6个水稻UXS基因家族序列为目标,对其基因结构、保守结构域、基因表达、系统进化等方面进行了综合分析.结果显示,12个UXS基因均有内含子,除OsUXS1基因仅在愈伤组织中表达外,其余11个基因在根、叶以及愈伤组织均有表达.12个UXS基因编码蛋白均存在较大范围的亲水区,有较强的亲水性.12个蛋白结构保守性较强,含有该基因家族的保守域3Beta- HSD和NAD - binding,分成2个亚家族,家族内结构相似的基因功能较为相似.综合分析表明,UXS是一个多基因家族,基因表达范围广,结构保守性强.

关键词：尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脱羧酶、拟南芥、水稻、生物信息学、结构与功能预测

所属期刊栏目：40

分类号：Q74(生物小分子的结构和功能)

资助基金：河北省青年自然基金C2010000919;唐山市科技局项目1014020C-4;河北理工大学博士自然基金

在线出版日期：2012-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：38-42