暗紫贝母甲羟戊酸途径关键酶HMGR的生物信息学分析

摘要：

以暗紫贝母的3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶氨基酸序列为研究对象,利用CD search、Cell-PLoc和SWISS-MODEL等生物信息学在线预测软件对其保守区域、理化性质、亚细胞定位、结构和活性区域等性质进行分析.结果表明,该酶由559个氨基酸残基组成,是主体部分位于内质网膜外的二次跨膜疏水蛋白质.其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成.三级结构为同源四聚体结构,活性区域由两条多肽链的66个氨基酸残基构成,活性区域的面积和体积分别为1284.340?2和2152.618?3.生物信息学手段分析预测结果揭示了暗紫贝母中3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶的性质、结构和功能,为进一步研究贝母活性生物碱的生物合成调控机制奠定理论基础.

关键词：暗紫贝母、3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶、生物碱、生物信息学

所属期刊栏目：36

分类号：R932;R318.04(生药学（天然药物学）)

资助基金：安徽省"十三五"医疗卫生重点专科"病原微生物实验室"皖卫科教[2017]30号;安徽省卫生计生委中医药科研课题"皖贝母内生真菌分离与鉴定"2014zy46

在线出版日期：2018-11-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1388-1394