暗紫贝母中法呢基焦磷酸合酶的生物信息学分析

摘要：

以暗紫贝母的法呢基焦磷酸合酶氨基酸序列为研究对象,利用CD search、ProtParam和SignalP等13种在线预测软件对其保守区域、理化性质、亚细胞定位、亲疏水性、二级结构、三级结构等性质进行分析.结果发现,该酶由352个氨基酸残基组成,是一种不含信号肽不跨膜、定位于线粒体基质的可溶性亲水蛋白,具有典型的类异戊二烯合成酶超家族结构域.其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成.三级结构以PDB ID 4kk2.1为模板建模,包含两个聚异戊烯合酶位点,200 Lys为其结合配体Mg2+的结合位点,活性区域由55个氨基酸残基构成,面积和体积分别为1215.670?2和1496.051?3.生物信息学手段分析预测结果揭示了暗紫贝母中法呢基焦磷酸合酶的性质、结构和功能,为进一步研究贝母活性生物碱的生物合成调控机制奠定理论基础.

关键词：暗紫贝母、法呢基焦磷酸合酶、生物碱、生物信息学

所属期刊栏目：36

分类号：R932;R318.04(生药学（天然药物学）)

资助基金：安徽省"十三五"医疗卫生重点专科"病原微生物实验室"皖卫科教[2017]30号;安徽省卫生计生委中医药科研课题"皖贝母内生真菌分离与鉴定"2014zy46

在线出版日期：2018-09-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1049-1055