人感染甲型H7N9亚型禽流感病毒血凝素蛋白同源建模与分子进化分析

摘要：

血凝素是流感病毒主要的中和抗原,也是流感病毒分型依据之一.为研究人感染甲型H7N9亚型禽流感病毒血凝素的结构特征和进化历史,从GenBank和GISAID数据库获取人感染甲型H7N9亚型禽流感病毒的血凝素序列数据,用BLAS7检索和分层抽样方法分别选取参比序列,进行多重序列比对,构建基于血凝素氨基酸序列的进化树.选取A/Shanghai/02/2013株为代表序列,用同源建模方法构建血凝素蛋白质三维结构模型,分别计算序列比对结果中各氨基酸残基同分类指标的互信息并投射到构建三维结构模型,观察代表性残基的分布趋势.结果表明各新发毒株的血凝素高度相似,且同我国浙江地区分离到毒株最为接近,新发毒株的代表性氨基酸残基主要分布在血凝素的头部表面.

关键词：流行性感冒病毒、血凝素、同源建模、分子进化

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分类号：R373.1;Q939.4(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金项目30800939;黑龙江省留学归国人员科学基金项目LC2012C38

在线出版日期：2014-02-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：40-46