基于生物信息学研究分析弥漫大B细胞淋巴瘤的潜在靶标与挖掘治疗药物

摘要：

为通过生信分析筛选参与弥漫大B细胞淋巴瘤发生发展的关键基因,预测治疗性小分子化学药物,从GEO和ICGC数据库中下载弥漫大B细胞淋巴瘤芯片和相关基因谱,使用R软件筛选共表达差异基因,对与芯片预后风险因素一致的基因取交集.通过STRING 11.0 数据库及Cytoscape 3.7.2 软件分析DEGs中的关键Top10 基因,获得差异基因,将关键基因导入医学本体信息检索数据库,筛选治疗淋巴瘤细胞的化学药物Palomid-529,利用R软件与Sanger Box软件,分别验证关键基因在弥漫大B细胞淋巴瘤数据集中的预后生存情况.纳入VSIG4、CCRL2、SIGLEC1、CD163 作为靶标分子对接,使用Autodock分子对接软件,分析治疗药物与关键基因转录的小分子-蛋白结合能情况.结果表明,Palomid-529 能与VSIG4、CCRL2、SIGLEC1、CD163 靶点对接,结合能量值分别为-6.12 KJ/mol、-6.79 KJ/mol、-5.17 KJ/mol、-8.99 KJ/mol,说明VSIG4、CCRL2、SIGLEC1、CD163 靶点有可能作为DLBCL的诊治及预后指标,而Palomid-529 有可能作为治疗此疾病的一个小分子药物,可为相关化学药物的开发提供靶标及研究思路.

关键词：弥漫大B细胞淋巴瘤、生物信息学分析、关键基因、治疗、化学药物

所属期刊栏目：14

分类号：R733.1(肿瘤学)

资助基金：天津市医学重点学科专科建设项目;国家自然科学基金

在线出版日期：2023-06-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：103-105