CAPS标记开发及果实相关性状QTL分析

摘要：

利用西瓜基因组重测序数据挖掘SNP位点并将其转变为CAPS标记,构建遗传连锁图谱,对西瓜果实相关性状进行QTL分析.以普通西瓜品系(Citrullus lanatus subps.vulgaris)花园母本和黏籽西瓜品系(Citrullus lna atus subsp.mucosospermus)PI 186490为亲本,构建BC1群体.对亲本材料进行基因组重测序,覆盖西瓜基因组20×以上,发掘SNP位点,运用SNP2CAPS软件选择7种限制性内切酶对包含SNP位点的序列进行酶切位点分析并将其转化为CAPS标记.筛选具有多态性的CAPS标记,对225株BC1群体内各单株进行基因分型,对西瓜果实相关性状进行QTL分析.在两亲本间共获得SNP位点751532个,设计CAPS引物450对,筛选出多态性引物200对,贡献率为44.44％.所构建遗传连锁图谱包含11个连锁群(分别对应西瓜基因组的11条染色体),覆盖基因组长度1376.95 cm.获得与果实相关性状QTL位点15个.说明西瓜是可溶性固形物,具有果肉硬度 、种子百粒重符合的数量性状遗传特点,种皮底色受四个QTL位点控制.

关键词：西瓜、遗传图谱、SNP、CAPS、QTL

所属期刊栏目：9

分类号：S651;Q943.2(瓜果园艺)

在线出版日期：2018-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-8