小豆WRKY基因家族鉴定及应答锈菌侵染的表达分析

摘要：

为明确小豆WRKY转录因子在抗锈病中的功能,研究采用生物信息学方法,对小豆基因组中WRKY基因家族进行了分析,结果表明,小豆基因组中共包含90个WRKY转录因子(VaWRKYs),其中82个成员分别定位于小豆的11条染色体上.依据WRKY基因家族高度保守的WRKY七肽域和锌指结构对小豆WRKY家族进行分类,发现VaWRKYs包含GroupⅠ(17个)、GroupⅡ(61个)和GroupⅢ(12个)等3个亚家族,进一步的系统发育分析表明,GroupⅡ亚家族还包括Ⅱ-a(6个)、Ⅱ-b(16个)、Ⅱ-c(21个)、Ⅱ-d(7个)和Ⅱ-e(11个)5个亚组.蛋白序列特征分析发现,VaWRKYs成员在七肽域和锌指结构上存在多个氨基酸位点的变异.利用课题组前期获得的抗病小豆品种接种后24和48 h的转录组数据对VaWRKYs成员的表达进行分析,共检测到82个成员不同水平表达,且多达67个成员的表达水平受锈菌侵染的影响,暗示小豆WRKY基因家族在小豆抗锈病过程中起重要的调控作用.

关键词：WRKY转录因子、小豆、豇豆单胞锈菌、基因表达

所属期刊栏目：34

分类号：S435.21(病虫害及其防治)

资助基金：黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划;黑龙江八一农垦大学学成、引进人才科研启动计划

在线出版日期：2022-12-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：36-44