Biolog和PCR-DGGE技术解析椒江口沉积物微生物多样性
采用Biolog和PCR-GGE技术对椒江口6个站位表层沉积物群落水平的微生物代谢功能和以16SrRNA基因标记的细菌遗传多样性进行分析,并对其代谢功能和群落结构与沉积物污染物等参数进行冗余梯度分析(Redundancygradientanalysis,RDA)和典范对应分析(Canonicalcorrespondenceanalysis,CCA).Biolog分析结果表明,微生物群落整体代谢活性由高到低的顺序为:潮问带(B1、B2)、人海口处(A3)〉人海口内(A1、A2)〉人海口外(A4);碳源代谢的Shannon-Wiener多样性指数范围为2.09-3.25,由高到低的顺序为:潮间带(B1、B2)、人海口处(A3)〉河道内(A1)〉近人海口处(A2)〉人海口外(A4);潮间带、人海口处及河道内的微生物对各类碳源的相对利用率较平均,而近人海口处和人海口外的微生物群落对聚合物的相对利用率较高,对氨基酸类和胺类的相对利用率较低.DGGE图谱分析表明,细菌群落结构沿河口盐度梯度存在空间异质性,但两潮间带站位的相似度高(82.27%);遗传基因的Shannon-Wiener多样性指数范围为1.68-2.87,由高到低的顺序为:潮间带〉人海口处〉人海口外〉近入海口处〉河道内.群落代谢功能与理化因子的RDA显示,有机质和硝基苯的分布能较好地解释微生物群落代谢功能的变化;群落遗传结构与理化因子的CCA显示,硝基苯和多环芳烃的分布能较好地解释细菌群落遗传结构的变化.综上结果认为,椒江口沉积物的微生物代谢及遗传多样性符合典型的河口特征,但人海口内微生物沉积环境已表现出对某些化工污染物的响应.
Biolog、PCR-DGGE、椒江口沉积物、微生物代谢功能、细菌群落结构、多样性
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X171(环境生物学)
国家重点基础研究发展计划973项目2010CB428903;中国近海海洋综合调查与评价专项ZJ908-01-01-3,ZJ908-02-02,ZJ908.04.02;浙江省自然科学基金Y5100401;国家海洋局青年海洋科学基金2010125;国家海洋局第二海洋研究所基本科研业务费专项资助项目JG200819
2012-07-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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