渤海湾天津沿岸海水中甲肝病毒的检测和定量

摘要：

甲肝病毒(hepatitis A virus, HAV)是能引起传染性甲型肝炎的单链RNA病毒.用常规RT-PCR(反转录PCR)和SYBR Green实时定量RT-PCR方法,根据甲肝病毒保守的VP1-VP2基因序列设计引物,对渤海湾天津沿岸海水中的甲肝病毒进行了检测和定量分析. 9个样品取自渤海湾天津塘沽以南沿岸海水,取样时间分别是2007年夏、秋、冬季和2008年春季. 海水样品先用小型超滤装置(Millipore Pellicon Mini TFF)或超滤离心管(Millipore Centricon Plus-70)浓缩,然后进行RT-PCR检测.结果表明,从9个海水样品中都能扩增出192 bp的HAV cDNA,这些cDNA的核苷酸序列与GenBank中的同源序列相似性为95%～100%. 用SYBR Green 实时定量RT-PCR检测了春季和冬季的6个海水样品,结果表明,海水中甲肝病毒的浓度范围为5.35×106～4.51×107 virus particles/L.

关键词：海水、甲肝病毒、RT-PCR、实时定量RT-PCR

所属期刊栏目：30

分类号：X55;X834(海洋污染及其防治)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2006AA09Z170

在线出版日期：2009-09-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1608-1613