基于不同测序技术的微生物群落结构比较

摘要：

文章分别采用变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)、克隆文库(clone li-brary,CL)及16S rRNA高通量测序(high-throughput sequencing,HS)技术,分析厌氧-缺氧-好氧(anaerobic-anoxic-oxic,A2/O)反应器稳定运行期间各个反应器内微生物群落结构多样性,评价3种测序技术在具体应用中的特色及其局限性.结果表明:对于厌氧反应器古菌分析,HS比DGGE和CL分别多检测出50.00％、83.00％,而在细菌分析中,HS比DGGE和CL分别多检测出21.42％、50.00％;对于缺氧反应器和好氧反应器中细菌的群落结构分析,3种方法测得的微生物种类差别不大.CL操作简单,适用于样品量少的情况;DGGE能直观地反映微生物群落的变化情况,但1次最多分析32个样品;而在分类水平低时,CL和DGGE会低估样品中微生物物种组成,高估相对丰度.

关键词：高通量测序(HS)、变性梯度凝胶电泳(DGGE)、克隆文库(CL)、厌氧-缺氧-好氧(A2/O)反应器、微生物群落

所属期刊栏目：43

分类号：X172(环境生物学)

资助基金：国家自然科学基金面上资助项目41572326;41772361

在线出版日期：2021-02-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1676-1683