DNA提取前处理方法对太岁里层样品中 细菌种群结构的影响
为了评价不同DNA提取前处理方法对太岁里层样品中细菌种群结构的影响,并解析优势结构,对太岁里层重复取样,在提取细菌DNA前,分别施以水浸提(SI1)、浸提后热溶解(SI2)、直接热溶解(SI3)3种不同前处理,同时与微孔滤膜过滤相结合,在高通量测序后以操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)为基础深度分析细菌种群结构.结果表明,SI1、SI2和SI3的Shannon指数分别为2.96、3.10和3.08,OTU数目分别为891、964和1095个,共有OTU 313个,其序列之和占总序列的96.02％.细菌种群在各分类水平上的数目互有差别,SI1最少,优势种群高度集中于假单胞菌属(Pseudomonas)和不动杆菌属(Acinetobacter),所占比例之和超过60％.其中,假单胞菌属独占42.30％～56.35％,较之前研究结果变化最大.OTU的分布和丰度在不同取样位置间不均衡.3种前处理方法测得的细菌结构近似,但以SI3测得的假单胞菌属中丰度最高OTU,在总序列中所占比例最高,为41.14％.
太岁、里层样品、DNA提取前处理、细菌种群结构
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Q938(微生物学)
河北省农林科学院农业科技创新工程项目2019-2-5-3
2020-01-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
896-902
