拟南芥类结瘤素基因At1g01070的生物信息学分析

摘要：

类结瘤素基因在非结瘤植物生长发育中承担着重要的功能,但仅少数基因的功能被鉴定.本研究对拟南芥类结瘤素MtN21(Medicago truncatula NODULIN 21)家族成员At1g01070进行了生物信息学分析及亚细胞定位验证.结果表明,At1g01070有两种可变剪切体,编码两种蛋白At1g01070.1和At1g01070.2,前者比后者在N端多47个氨基酸,它们的分子量分别为40 KD和35 KD,等电点分别为9.2和8.9;均含有2个MtN21蛋白的特征结构域EamA(药物/代谢物转运结构域),At1g01070.1比At1g01070.2多一个PLN00411结构域,且其靠近N端的EamA结构域较后者长;三级结构均由7个a-螺旋和一些不规则卷曲组成,分别含有10个和8个疏水跨膜区,均含13个磷酸化修饰位点,亚细胞定位预测主要定位在质膜;进化上,与琴叶拟南芥(Arabidopsisl yrata)亲缘关系最近;亚细胞定位结果显示At1g01070.1定位在质膜,与预测结果一致.推测At1g01070在植物体内可能参与物质运输.

关键词：类结瘤素基因、At1g01070、MtN21、生物信息学分析、亚细胞定位

所属期刊栏目：45

分类号：Q945.31(植物学)

资助基金：国家自然科学基金31601241;河南省高校科技创新团队15IRTSTHN020;河南师范大学博士科研启动基金39970774

在线出版日期：2017-06-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：58-64