大鼠肝再生中肝细胞基因表达与DNA裸露的相关性研究

摘要：

为了解大鼠肝再生中肝细胞的基因表达与DNA裸露的相关性,分离大鼠肝细胞,提取裸露DNA,用SOLEXA方法对DNA测序,用BWA软件拼装测序片段,用IPA软件分析拼装的基因种类和作用,用Rat Genome230 2.0芯片检测基因的转录情况.研究表明,大鼠肝再生的12 h(PH后12 h),肝细胞的裸露DNA涉及16 912个基因,1 701个基因发生了有意义裸露量变化.其中,25个基因的裸露量上调,1 676个基因的裸露量下调.与Rat Ge-nome 230 2.0芯片的检测的基因转录比对表明,肝细胞的AKR7A3,BMYC,CDC25B等26个基因的裸露量和表达量均下调,表明大鼠肝再生12 h时,这些基因的表达可能受染色体结构调控.

关键词：大鼠肝细胞、大鼠肝再生、裸露DNA、基因转录

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分类号：Q291

资助基金：国家重点基础研究发展计划项目973计划2012CB722304;河南省基础与前沿技术研究计划项目102300413213

在线出版日期：2014-02-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：172-177