基于RNA-Seq技术的毕赤酵母基因组重注释及新型强启动子的发现与序列分析

摘要：

使用RNA-Seq技术,对毕赤酵母进行了转录组测序.基于测序结果,对现有毕赤酵母基因组进行了重注释,修正了基因组序列中的错误位点861处,发现了新转录本249个及可变剪切现象83个,并更正了553个转录本的错误注释.经过表达谱分析,在毕赤酵母中发现了2个新型强启动子,分别命名为P437和P1431,其驱动的转录本的最高转录水平分别为AOX1基因的1.78倍和3.40倍.序列分析显示,P437和P1431序列中存在着多个酵母转录因子的结合位点.

关键词：毕赤酵母、RNA-Seq、基因组重注释、启动子

所属期刊栏目：40

分类号：Q933(微生物学)

资助基金：上海市重点学科建设项目B505

在线出版日期：2016-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：167-175