枣TCP家族基因鉴定及其表达分析

摘要：

为了揭示枣TCP基因家族在枣生长发育中的作用,本文利用枣全基因组数据库搜索TCP家族基因,对该类基因进行鉴定、染色体分布等生物信息学和表达分析.结果 表明,枣TCP基因家族包含22个成员,蛋白长度范围为172～590个氨基酸,等电点为4.88～5.25,全部为亲水蛋白;其中15个基因分布在6条染色体上,5号染色体最多,有4个;聚类分析发现,该类基因可分为Class I和ClassⅡ2类,ClassⅡ又分为CYC/TB1和CIN亚类;组织特异性表达分析表明,该类基因主要在叶、蕾、花和果中表达;同时,植原体侵染对该类基因的表达有显著影响.蛋白互作预测发现ZjTCP和其他蛋白以及同一家族蛋白内部之间均可以发生互作.本研究结果为进一步研究该类基因的功能提供了重要线索和依据.

关键词：枣、TCP转录因子、鉴定、生物信息学分析、表达分析

所属期刊栏目：42

分类号：S665.1(果树园艺)

资助基金：河北省杰出青年基金项目资助C2016204145

在线出版日期：2019-12-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：39-45