基于16S-rDNA序列的核桃细菌性疫病病原菌遗传多态性分析

摘要：

核桃细菌性疫病(Xanthomonas arboricola pv.juglandis)是世界范围内核桃产区最主要的细菌病害,对其病原菌16S-rDNA的序列进行分析,为阐明其遗传多样性提供参考.本研究从湖北省保康县和丹江口市多个核桃园采集病样,对不同核桃病组织样进行分离纯化,得到77个病原菌类似菌株,对部分菌株进行了接种和分子鉴定.用通用引物27F和1492R对其中有代表性的22株进行16S-rDNA的PCR扩增和测序.用软件MEGAT.0对所有测序结果进行遗传发育树分析,菌株之间平均遗传距离为0.244.用3种限制性内切酶MspI 、AfeI和HinfI对16S-rDNA的PCR产物进行酶切,酶切结果用软件NTSYSpc2.1进行聚类分析.所有菌株之间相似系数大于52％,在76％的相似水平,可以将22个菌株划分为6个类群.用软件ApE对所有序列进行同样的3个酶切,RFLP分析结果与试验酶切结果相似.不同方法构建的聚类和发育树分析结果表明,湖北省不同地理来源和病组织的菌株存在一定的遗传多态性.

关键词：核桃细菌性疫病、16S-rDNA、RFLP、MEGA、遗传多样性

所属期刊栏目：39

分类号：S664.1(果树园艺)

资助基金：湖北省教育厅重点项目D20162701

在线出版日期：2016-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：63-68