本氏烟草NbEHD1基因的生物信息学分析、CRISPR/Cas9载体构建及遗传转化

摘要：

为了研究本氏烟草NbEHD1基因的生物学功能,采用生物信息学方法对其基因结构、蛋白保守结构域、磷酸化位点、亚细胞定位及进化关系等多个方面进行预测.结果表明,本氏烟草NbEHD1编码序列全长1638 bp,其基因组序列包含16个外显子和15个内含子.NbEHD1蛋白大概率定位于细胞质中,无信号肽,无跨膜区,蛋白序列有42个磷酸化位点.NbEHD1属于P-loop_NTPase超家族,具有EHD家族特有保守结构域.系统进化关系结果表明,本氏烟草NbEHD1与马铃薯、番茄的EHD序列亲缘关系较近.经与SGN数据库中本氏烟草测序数据比对,获得NbE-HD1预测的全序列并设计基因特异性引物,扩增得到其序列全长.在获得NbEHD1 CRISPR/Cas9基因编辑载体后,采用农杆菌介导的方法,将此载体成功转化到本氏烟草叶片,经鉴定成功获得T0阳性植株16株,为进一步确定NbEHD1基因的生物学功能提供了研究材料.

关键词：本氏烟草、NbEHD1、生物信息学分析、CRISPR/Cas9

所属期刊栏目：38

分类号：Q94;S572.03(植物学)

资助基金：内蒙古自然科学基金项目;国家自然科学基金

在线出版日期：2023-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：77-83