观赏辣椒ARP基因克隆及表达分析

摘要：

为研究ARP在观赏辣椒低温胁迫下的响应情况,旨在为后续观赏辣椒低温下基因功能研究提供理论基础.通过RT-PCR技术从观赏辣椒中克隆得到与辣椒、番茄、马铃薯的同源ARP基因,命名为CfARP,分析其在观赏辣椒不同组织以及低温处理下的表达情况;通过利用生物信息学分析进行基因蛋白编码情况、理化性质、基因亲缘关系研究,并利用qRT-PCR技术检测CfARP在观赏辣椒不同组织以及低温处理下的表达量.结果表明,CfARP基因CDS序列为342 bp,与辣椒(遵辣1号)同源性为100％,可编码113个氨基酸,含有一个保守的Auxin-repressed结构域;蛋白理化分析发现,CfARP蛋白分子量为12.156 ku,等电点为10.22,亲水性平均系数为-0.913,初步预测CfARP为亲水性蛋白;与其他物种ARP氨基酸序列对比发现,CfARP在茄科植物中高度保守.实时荧光定量PCR结果显示,CfARP基因在观赏辣椒茎中表达量最高,根中次之,叶和花中相对较少;CfARP基因的表达量随着低温处理时长的增加而不断升高.初步推测CfARP在观赏辣椒响应低温胁迫过程中具有一定作用.

关键词：观赏辣椒、CfARP、基因克隆、生物信息学分析、qRT-PCR、低温胁迫

所属期刊栏目：38

分类号：S641.03;Q78

资助基金：国家自然科学基金;贵州省生物学国内一流学科建设学科开放基金;贵州省科技厅一般基金项目;贵州大学培育项目

在线出版日期：2023-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：69-76