肉牛剩余采食量相关下丘脑差异lncRNA筛选及特征分析

摘要：

剩余采食量(RFI)是用于评价家畜饲料利用效率的重要指标之一,其受消化代谢、肠道免疫、运动及下丘脑采食中枢等多种因素调控.lncRNA是一类参与众多生物学过程的非编码RNA分子,在疾病等表型研究中得到广泛研究,但有关下丘脑lncRNA表达特征及其与牛采食量调控存在何种联系仍不明确.旨在筛选下丘脑中与RFI相关的lncRNA,探究lncRNA与饲料利用率之间的调控关系.选择极端高、低RFI安格斯牛为材料,采集下丘脑组织样本,经总RNA提取、文库构建及高通量测序后开展 RFI相关差异表达 lncRNA筛选及调控通路分析.共鉴定出 105 个差异表达lncRNA,其中46 个lncRNA在LRFI组下调,59 个上调,这些差异lncRNA预测靶基因主要富集于线粒体相关的氧化磷酸化及生热作用等通路;同时上述通路中相关基因(ATP酶、呼吸链复合物)主要与差异表达lncRNA(LNC_006637、LNC_007569、LNC_012079、LNC_005449)相关;蛋白互作网络分析构建的网络中的一些基因(NDUFA4、SDHD、UQCRH)也已被报道为与家畜饲料效率相关.以上结果表明,牛剩余采食量相关的下丘脑组织可能主要通过生热作用及氧化磷酸化信号通路对机体线粒体功能及能量利用进行调节,但这需要更多的细胞试验进行验证.

关键词：肉牛、剩余采食量、lncRNA、下丘脑、生物信息学

所属期刊栏目：38

分类号：S823.8(家畜)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;宁夏自然科学基金项目;宁夏自然科学基金项目

在线出版日期：2023-09-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：213-224