菜用大豆有机酸的全基因组关联分析

摘要：

为了研究菜用大豆有机酸合成机制并为菜用大豆的品质改良提供一定的理论依据,以含有 264 份菜用大豆种质资源的自然群体为试验材料,分别在2020,2021 年采用HPLC法测定该群体的酒石酸、苹果酸和柠檬酸含量,并结合该群体的基因型数据进行全基因组关联分析,鉴定与有机酸含量显著关联的SNP位点及候选基因.2020,2021 年供试群体酒石酸平均含量分别为4.13,4.16 mg/g,苹果酸平均含量分别为7.26,8.99 mg/g,柠檬酸平均含量分别为7.12,10.88 mg/g.相关性分析发现,264 份材料柠檬酸含量在2020 及2021 年2a间呈显著正相关.同时,苹果酸与柠檬酸间呈显著的正相关,相关系数为 0.790?,酒石酸与苹果酸、柠檬酸均呈显著正相关,相关系数分别为0.695?,0.739?.结果表明,供试群体不同品种间存在较大差异,具有丰富的遗传多样性,筛选出 6 份具有较高有机酸含量的特异种质资源,为菜用大豆有机酸品种改良育种提供优秀的材料.基于混合线性模型的GWAS分析,共检测到54,189,43 个分别与酒石酸、苹果酸及柠檬酸含量显著相关的SNP位点,同时根据基因功能注释信息,鉴定到3 个及5 个分别与酒石酸、苹果酸含量显著相关的候选基因.

关键词：菜用大豆、SNP、全基因组关联分析、有机酸、HPLC

所属期刊栏目：38

分类号：S565.03;Q78(经济作物)

资助基金：江苏省农业科技自主创新资金项目;江苏省重点研发计划现代农业重点项目;国家重点研发计划;江苏省林业科技创新与推广项目

在线出版日期：2023-09-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：74-82