猪细小病毒1型突变株分离鉴定及全基因组进化分析

摘要：

旨在对猪细小病毒1型(PPV1)突变株生物学特性进行分析.对采自山东不同地区养猪场的67份流产胎儿组织样品进行PPV的分离和培养,经电镜观察和IFA试验进行鉴定,通过Overlap PCR对分离株进行全基因序列扩增,SnapGene V4进行序列拼接和比对,利用DNAMAN V6对基因组末端5′UTR和3′UTR二级结构进行展示和比较,应用MEGA V7进行遗传进化分析,最后利用多步生长曲线绘制对分离株在易感细胞内的增殖能力进行比较.共分离得到3株病毒,均鉴定为PPV1型毒株,分别命名为SDPV1、SDPV2和SDPV3,GenBank登录号分别为ON924737、ON924738和ON924739;3个分离株全基因序列长度基本一致,其中5′-UTR序列高度保守,呈Y型结构;而3′-UTR呈U型结构,个别碱基有所差异;VP2氨基酸序列中有5个非同义突变位点,分别为T20A、R82K、Q226E、D366N和K407N,为国内毒株首次发现.生长曲线显示,突变株生长趋势相对较快,与PPV-QN株相比,最高滴度相差10倍.报道了包含新型变异位点的PPV毒株的基因组特征.

关键词：猪细小病毒1型、突变株、全基因组、遗传变异

所属期刊栏目：38

分类号：S852.651(动物医学（兽医学）)

资助基金：山东省生猪产业技术体系;青岛农业大学高层次人才科研基金项目;青岛农业大学博士启动基金

在线出版日期：2023-04-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：232-238