牦牛lncFAM200B的克隆鉴定、表达及生物信息学分析

摘要：

旨在克隆鉴定牦牛lncFAM200B,为探索其在牦牛肌肉和脂肪发育过程中的调控作用奠定基础.以臀肌cDNA为模板,设计特异性引物扩增lncFAM200B全长序列,用在线软件CPC、CPAT对该lncRNA的编码能力进行预测,进一步通过原核表达试验鉴定其编码能力;采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对lncFAM200B进行组织表达分析,通过TargetScan 7.1和miRanda预测与lncFAM200B具有潜在相互作用miRNA的靶基因,利用DAVID在线软件对靶基因进行GO和KEGG分析.结果显示,牦牛lncFAM200B长度为531 bp;相较于普通牛多59 bp,编码潜能为-1.2874,且原核表达试验验证该lncRNA不具备蛋白编码能力,表明牦牛lncFAM200B确为lncRNA;组织表达谱研究表明,lncFAM200B在牦牛肺脏组织中表达量较高.与lncFAM200B具有潜在相互作用miRNA的靶基因,如Sirt1、SCD5、KLF9、PTEN和MYPN等,与肌肉和脂肪发育相关.为进一步探讨牦牛lncFAM200B在肌肉和脂肪发育中的生物学功能提供参考依据.

关键词：牦牛、lncFAM200B、克隆、组织表达、肌肉发育

所属期刊栏目：35

分类号：S823.85;Q78(家畜)

资助基金：西南民族大学研究生创新型科研项目;国家肉牛牦牛产业技术体系项目;青藏高原生态畜牧业协同创新中心开放基金;西藏自治区财政专项

在线出版日期：2020-12-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：220-230