转录组分析不同砧木对嫁接烤烟抗青枯病的影响

摘要：

为研究不同砧木对烟草嫁接苗抗病性的影响,明确抗病材料云烟87(Y87)作为砧木提高接穗红大金元(HD)对青枯病抗性的机理,采用劈接加生料带缠绕法以易感青枯病品种HD作为接穗,以HD和Y87作为砧木,分别构建HD/HD和HD/Y87嫁接烤烟苗,然后测量HD/HD和HD/Y87保护性酶苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性的变化,最后利用高通量测序技术和Illumina HiSeqTM 4000测序平台,提取5株HD/HD或HD/Y87 mRNA,反转录构建总cDNA文库,测序,过滤低质量Reads后,用TopHat2比对参考基因组,用Cufflinks和DESeq软件获得基因表达量和差异表达基因.结果发现,不同取样时间HD/Y87 PAL活性均显著高于HD/HD,4个样品分别得到48414474～48697874条Clean Reads和38272～40938条基因,但HD/Y87发生选择性剪切事件数高于HD/HD;比较HD/Y87和HD/HD两组间基因表达量,得到3904条差异基因,其中3096条基因上调,808条基因下调;在上调基因中有参与木质素合成的3条编码苯丙氨酸解氨酶基因,5条Myb家族转录因子基因,5条编码多酚氧化酶基因;还有2条病程相关蛋白基因和3条相应的ERF转录因子基因等.这些结果表明,Y87作为砧木能够提高接穗HD PAL活性和多种抗性基因(包含木质素、多酚及病程相关蛋白)表达量,从而提高接穗红大金元对青枯病等病害抗性.

关键词：烟草、嫁接、转录组、苯丙氨酸解氨酶、多酚氧化酶、病程相关蛋白

所属期刊栏目：35

分类号：S604;Q78(一般性问题)

资助基金：四川省烟草专卖局公司项目 川烟科[2014]6号

在线出版日期：2020-09-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：177-186