拟环纹豹蛛响应温度胁迫SNP位点挖掘及其功能注释分析

摘要：

单核苷酸多态性(SNP)是基因组中普遍存在的遗传变异,是一种重要的遗传标记.为了解拟环纹豹蛛转录组中响应温度胁迫的SNP候选位点及SNP所在基因SNP-Unigenes的功能注释,主要采用SOAPsnp软件对拟环纹豹蛛在不同温度胁迫条件下的转录组测序结果进行SNP检测,并把SNP所在基因SNP-Unigenes比对到GO、COG、KEGG数据库,获得SNP-Unigenes的注释及参与的功能情况.结果表明:拟环纹豹蛛转录组SNP位点分布在7421条SNP-Unigenes上,共存在402910个SNP位点,SNP发生频率为1/301 bp;功能注释分类揭示拟环纹豹蛛在低温胁迫和高温胁迫条件下,SNP-Unigenes主要参与蛋白质转运、核糖体代谢、氧化磷酸化和氨基酸代谢功能,从而补偿热应力下蛋白质的损伤,加快拟环纹豹蛛对温度变化的适应.综上,筛选到拟环纹豹蛛响应温度胁迫相关的SNP位点或SNP-Unigenes,为将来深入研究拟环纹豹蛛响应温度胁迫的分子机制提供基础数据.

关键词：拟环纹豹蛛、温度胁迫、单核苷酸多态性

所属期刊栏目：34

分类号：S81(普通畜牧学)

资助基金：贵州省科技厅科技支撑项目;贵州省教育厅青年科技人才成长项目;贵州省科技计划项目

在线出版日期：2020-03-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：331-339