高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析

摘要：

糖转运蛋白(Sugar transporter protein,STP)基因家族在植物单糖分配中具有重要作用,并参与植物生长和发育过程中的许多代谢进程.为探究STP基因家族在高粱生长发育中的潜在功能,对高粱STP基因家族进行了全基因组鉴定、分类和组织表达分析.从高粱基因组中共鉴定出19个包含Sugar_tr结构域的STP基因,不均匀分布于9条染色体上,其中有4个基因位于基因组重复区.19个SbSTP根据其系统发育特征可以分为5组,同组的家族成员具有相同或类似的基序类型和排列顺序,但在内含子和外显子数量上存在较大差异.RNA-Seq数据分析显示,至少有18个SbSTP基因可以表达,不同的基因在不同的组织中具有不同的表达模式,其中SbSTP11特异性在花中表达,Sb-STP4、SbSTP5在特定组织中受ABA和PEG的诱导表达.为进一步研究单个SbSTP基因的生物学功能,挖掘SbSTP家族的应用潜力奠定了基础.

关键词：高粱、STP、基因家族、系统进化、表达分析

所属期刊栏目：34

分类号：Q78;S514.03(基因工程（遗传工程）)

资助基金：广东省自然科学基金项目2016A030307007;中国热带农业科学院科技创新团队专项资金1630102017002

在线出版日期：2019-12-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：65-73