砂藓RcPIP2基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

水通道蛋白是一类较小的跨膜蛋白质,在植物抵御非生物胁迫过程中具有非常重要的作用.为了研究砂藓水通道蛋白基因的生物学功能,利用干旱处理转录组测序获得的序列信息,克隆获得1个水通道蛋白家族中质膜内在蛋白基因序列,命名为RcPIP2.生物信息学结果显示,RcPIP2基因全长序列为1267 bp,包含807 bp的开放阅读框,编码含有268个氨基酸残基的蛋白质.该蛋白质分子质量预测为28.3 ku,理论等电点为6.64,为疏水性较强的稳定性蛋白;无信号肽,为非分泌型蛋白;含有6个跨膜结构域.保守结构域分析发现,RcPIP2具有膜内在蛋白(MIP)家族信号序列、高等植物高度保守序列HINPAVTFG和2个天门冬酰胺-脯氨酸-丙氨酸(NPA)基序.二级结构包括α螺旋(37.31％)、β折叠(20.9％)、无规则卷曲(38.43％).三级结构预测发现,RcPIP2蛋白质的立体结构为典型的四聚体形式,由4个圆筒状亚基和中间的孔道构成.系统进化树分析表明,RcPIP2与小立碗藓中的PIP2蛋白质亲缘关系较近,聚为一类.由此推测,RcPIP2基因为水通道蛋白家族成员.

关键词：砂藓、RcPIP2、水通道蛋白、克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：34

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金项目31570207;黑龙江省省属高等学校基本科研业务费科研项目135209262,USTSXK201834;黑龙江省自然科学基金重点项目ZD201408

在线出版日期：2019-12-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：30-36