向日葵锈菌弹性金属蛋白酶基因克隆及生物信息学分析

摘要：

为了研究向日葵锈病的致病机制,将向日葵锈菌转录组中表达量较高的一个基因(KU994904)中成熟部分进行生物信息学分析及基因克隆.利用Interpro对蛋白ORF区域进行分析,确定其成熟区域,通过生物信息学相关软件对其进行结构预测及预测分析,从向日葵锈菌中提取总RNA,并利用RT-PCR方法扩增此蛋白酶成熟基因并克隆.结果显示:该蛋白酶成熟基因序列全长1335 bp,编码445个氨基酸,分子质量49.5 ku,其与M36家族中5条序列具有较高相似性,并发现同胞外金属蛋白酶基因序列相似度达到53.77％.因此,推断其为弹性金属蛋白酶.

关键词：向日葵锈菌、弹性金属蛋白酶、克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：34

分类号：Q78;S432.01(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金项目31760509,31360422;国家向日葵现代产业技术体系CARS-16

在线出版日期：2019-07-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：186-193