荠菜生长素极性运输基因1(CbPIN1)的克隆与表达分析
为了探讨荠菜PIN1基因的生物学功能,根据GenBank中拟南芥PIN1氨基酸序列,设计同源引物,通过RT-PCR技术,克隆了荠菜PIN1基因(CbPIN1)编码区cDNA序列;生物信息学方法分析了荠菜PIN1蛋白结构特征,并进行了亚细胞定位与原核表达;荧光定量PCR方法检测了PIN1组织表达特性;构建了植物表达载体pBI121-CbPIN1,并获得转基因植株.结果表明,CbPIN1 cDNA序列全长1869 bp,C+G含量为49%.Blast比对结果显示,CbPIN1与拟南芥PIN1基因高度同源,相似性高达93%.进一步分析发现,CbPIN1可编码1条622个氨基酸的多肽,CbPIN1蛋白分子质量为67.05 ku,等电点为9.02,碱性氨基酸(K、R)个数为49,酸性氨基酸(D、E)个数为42,疏水氨基酸(A、I、L、F、W、V)个数为241,极性氨基酸(N、C、Q、S、T、Y)个数为157.CbPIN1属于跨膜蛋白,含12个丝氨酸磷酸化位点,1个苏氨酸磷酸化位点.亚细胞定位结果显示,CbPIN1定位于细胞膜;CbPIN1在荠菜不同组织均有表达,其中,根中表达最高,种子中表达最低.原核表达显示CbPIN1蛋白大小87.05 ku.过表达荠菜植株中CbPIN1基因表达量均显著增加.试验结果为进一步分析CbPIN1在荠菜器官发育中的作用奠定了基础.
荠菜、生长素极性运输基因1、基因克隆、表达分析
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Q71;Q78;S647.03(生物大分子的结构和功能)
贵州省科技计划项目黔科合基础[2018]1069;贵州省科技计划项目黔科合平台人才[2017]5789
2019-04-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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