miR-181a-5p靶基因预测及其在鹅卵泡颗粒层中的表达分析

摘要：

为深入探究miR-181a-5p在鹅颗粒细胞中可能的功能及其作用机制奠定基础.以多个网络数据库资源为基础,通过生物信息学的方法预测可能的靶基因及其信号通路,然后利用qPCR检测miR-181a-5p及其靶基因在不同阶段颗粒层中的表达水平.结果显示,miR-181a-5p在脊椎动物中高度保守;靶基因的GO和KEGG分析发现,miR-181a-5p主要参与调控细胞的增殖、分化、凋亡等过程,多数靶基因主要富集到FOXO、MAPK、PI3K-Akt等信号通路;根据靶基因互作网络图,筛选出10个核心靶基因VEGFA、MAPK1、FOS、KRAS、HRAS、SIRT1、BCL2、ESR1、PTEN和CD-KN1A,其中多数靶基因均与细胞增殖凋亡相关.结果表明,miR-181a-5p在2～4 mm表达量最高,但在4～6 mm急剧下降,之后在4～6 mm、8～10 mm、F5这3个阶段均呈现显著上升趋势.miR-181a-5p可能通过靶向调控SIRT1、BCL2、CDKN1B、PTEN等基因,参与FOXO、MAPK、PI3K-Akt等信号通路来调控颗粒细胞的增殖凋亡过程.

关键词：miR-181a-5p、GO和KEGG分析、表达分析、颗粒细胞、增殖、凋亡

所属期刊栏目：33

分类号：S835(家禽)

资助基金：国家现代水禽产业技术体系CARS-42-4;国家科技支撑计划项目2015BAD03B06;国家自然科学基金项目31672424

在线出版日期：2019-02-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：95-102