雪菜BjSnRK2C基因的克隆及生物信息学分析
SnRK2家族基因编码植物体内一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,是ABA通路中影响植物抗逆能力的关键调控基因.基于SnRK2成员cDNA的保守区序列信息,利用RT-PCR与SON-PCR相结合的方法从雪菜中克隆了一个SnRK2全长cDNA序列,命名为BjSnRK2C.测序结果显示,该cDNA序列全长1380 bp,包含一个137 bp的3′-非翻译区,一个214 bp的5′-非翻译区,一个1029 bp的完整开放阅读框,编码342个氨基酸,在GenBank数据库的登录号为MF983711.BjSnRK2C蛋白激酶理论分子量为38.2 ku,理论等电点为5.61,属于亲水性蛋白,存在2个显著跨膜结构域,含有30处磷酸化位点,没有信号肽,最可能定位的位置是在细胞质上.BjSnRK2C蛋白激酶的二级结构具有130个 α-螺旋、126个无规则卷曲、59个延伸链和27个 β-转角.BjSnRK2C蛋白包含1个丝氨酸/苏氨酸酶活性结构域和1个ATP结合位点,同拟南芥AtSnRK2.8蛋白激酶亲缘关系最近,处在同一进化分枝.雪菜BjSnRK2C蛋白激酶的三级结构与拟南芥AtSnRK2.8蛋白激酶极为相似,推测它们具有类似的功能.BjSnRK2C蛋白激酶的C末端仅含有结构域Ⅰ,缺少结构域Ⅱ,暗示雪菜BjSnRK2C基因在参与非生物胁迫过程中很可能也是不依赖ABA调控通路的.研究结果可为今后深入研究BjSnRK2C功能奠定理论基础.
雪菜、BjSnRK2C基因、克隆、生物信息学
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S649
国家自然基金项目31860389;内蒙古自治区自然科学基金项目2018MS03057;内蒙古民族大学博士科研启动基金项目BS404;内蒙古自治区饲用作物工程技术研究中心开放课题MDK2017004,MDK2018033
2019-02-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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