牦牛IGF-IR基因克隆及其序列分析
为研究牦牛胰岛素样生长因子1受体基因(IGF-IR)的结构和功能,采用同源克隆和RT-PCR方法分段扩增牦牛IGF-IR,拼接获得全长序列,利用生物学软件进行分析.结果表明,牦牛IGF-IR基因ORF长约4104 bp,编码1367个氨基酸;理论分子量约154.95 ku,等电点pI值约5.71.与黄牛IGF-IR比较,牦牛IGF-IR基因序列有20处碱基改变,其中G到T碱基颠换2次,G到A碱基转换2次,C到T碱基转换7次,A到G碱基转换3次,T到C碱基转换6次,以及3个位点氨基酸改变(G6R、T29I和S30I).系统进化分析表明,牦牛与黄牛、猪、人、狗、小鼠、猩猩等物种IGF-IR氨基酸相似性均大于92%,处于同一进化分支,具有高度同源性.蛋白结构预测表明,牦牛IGF-IR包含半胱氨酸富集区(FU)、纤连蛋白Ⅲ型结构域(FN3)、跨膜结构域(TM)及酪氨酸蛋白激酶区(TyrKc),具有该受体家族的特征结构域.同源建模表明,其成熟区段氨基酸序列与人的IGF-IR有98.68%的相似性.为后续牦牛IGF-IR基因的功能研究奠定了基础.
牦牛、IGF-IR基因、克隆、序列分析
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Q78;S823(基因工程(遗传工程))
国家重点研发计划项目2018YFD0502400;甘肃省草食畜产业技术体系;中国农业科学院牦牛资源与育种创新团队CAAS-ASTIP-2014-LIHPS
2018-11-28(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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