水稻纹枯病菌谷胱甘肽S-转移酶基因的生物信息学及表达分析
通过生物信息学方法及表达分析对水稻纹枯病菌谷胱甘肽S转移酶基因(Rsgst)的功能进行探索.通过水稻纹枯病菌RSIADB基因组数据库查找Rsgst序列,确定该基因在水稻纹枯病菌基因组中的精确位置.利用生物信息学软件预测Rsgst编码蛋白氨基酸序列的基本信息,并使用 MEGA 5.0软件构建同源蛋白的系统发育树,最后用qRT-PCR检测Rsgst在菌核发育过程中的基因表达量,同时测定GST的酶活性.结果表明,Rsgst全长1207 bp,该基因共编码277个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为30.90 ku,理论等电点为9.42.该蛋白二级结构中以α-螺旋为主,占41.52%.系统发育树表明,水稻纹枯病菌GST蛋白与担子菌类玉米丝黑穗病菌GST蛋白亲缘关系最近.qRT-PCR结果表明,Rsgst在水稻纹枯病菌菌核发育过程中表达量不断上调,基因最高表达量是在第60小时,为7.64,而Rsgst的最高酶活性是在第5天,其酶活为0.375 U/μg.结果可为预测水稻纹枯病菌中Rsgst基因的功能奠定基础.
水稻纹枯病菌、谷胱甘肽S-转移酶、菌核发育、酶活测定、基因组定位
33
S432.1;Q78(病虫害及其防治)
广东省自然科学基金博士启动项目2016A030310454;国家自然科学基金项目31271994
2018-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
45-51
