蓖麻RcDELLA基因的克隆及序列分析
DELLA家族蛋白是植物GA信号途径的重要阻遏蛋白,能抑制植物的生长和发育,使植株产生矮化的表型.为了明确DELLA基因在蓖麻中的作用和功能,对RcDELLA基因进行生物学信息分析.以蓖麻2129六叶期茎尖的cDNA为模板,根据NCBI公布的DELLA(XM 002533984.2)蛋白基因片段设计引物,克隆该基因,并对其进行生物信息学分析.克隆得到该基因的完整阅读框,该基因编码序列全长为1701 bp,编码567个氨基酸,推测其分子量为62550.40 ku,等电点为5.14.二级结构预测表明α-螺旋占40.4%,β-折叠占8.6%,无规则卷曲占51.0%.系统进化树结果表明,RcDELLA先与大戟科巴西橡胶树和麻疯树形成分支.通过PCR扩增得到了RcDELLA基因的完整阅读框,同源性比对结果显示,RcDELLA具有典型的DELLA结构域,与NCBI上公布的其他植物的DELLA蛋白序列具有高度的同源性.系统进化树结果显示,与麻疯树亲缘关系最近,符合进化关系.生物信息学分析将为进一步研究DELLA基因在蓖麻矮化过程中的作用和功能奠定理论基础.
蓖麻、DELLA、序列分析、系统进化
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S565.03;Q78(经济作物)
国家自然科学基金项目31460353;内蒙古民族大学市校合作项目SXZD2012006,SXZD2012017;2015年全区研究生科研创新资助项目S20151013601;内蒙古自治区科技创新引导项目KJCX15002;内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心项目;内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室开放基金项目MDK2016030
2018-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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